Chyba trochę za bardzo zgeneralizowałem. Nie powinno być chaosu tam, gdzie są bazy FB. Część PODGiK'ów została niestety z tyłu, i tam problemy będą. Receptą jest eksport z definicją warstw i  pobieranie menu aktywności do zgłoszonej pracy.

Już skończyły się czasy, gdy każdy ośrodek miał zestaw swoich warstw oraz menu. Dzisiaj wszyscy korzystają z tych samych warstw, tych samych menu. Co do szkoleń, zerknij na stronę GEOBIDU, oni prowadzą szkolenia on-line.

Baza\konfiguracja\wyświetlanie\linie i symbole:
ustaw odpowiednio NK1-3LN.LIN dla linii oraz NK1-3N.smb dla symboli.
Pliki znajdziesz w katalogu głównym ewmapy

Z patefonu?

Ale gdzie jest problem, bo nie do końca rozumiem?

Robocze punkty wgrywasz sobie na roboczą warstwę, po staremu. Normalnie uzbrojenie projektowane i istniejące jest w tej samej bazie. Skoro jednak Tobie pojawiły się oddzielne pozycje, moim zdaniem powinieneś to wgrać u siebie do oddzielnych baz.

Punkty\Przeglądanie punktów aktywnej bazy\Zaznacz/odznacz punkty przez okno wyboru (ikona z trzema "V")
Używając filtra po kolei wybierasz punkty z poszczególnych operatów.  Po wybraniu w oknie "przeglądarka punktów bazy" zaznacz "wyświetlaj tylko zaznaczone"
Dodatkowo zaznacz "Pozycjonowanie do wybranego obiektu".
Przeglądając po kolei, kontrolując jak siedzi z orto i zmieniaj co trzeba. Jest też opcja "Grupowej modyfikacji danych". Używaj z rozsądkiem

Powiedz, co chcesz zrobić (wizualizować, eksportować, modyfikować ....), wtedy łatwiej będzie Tobie pomóc.

Eksportuj z boku, filtruj np datą utworzenia ...

Jeśli działasz na plikach do modyfikacji to olewasz, nie ma to większego znaczenia. Właściwy operat będzie nadany przy wgrywaniu do bazy ośrodka dokumentacji. To co wpiszesz w swojej roboczej bazie to tylko to, co wpisałeś w swojej roboczej bazie

Dla chcącego nic trudnego. Może nie chciałeś aż tak bardzo ...
A tak poważniej, założyłem, że chodziło o to, że dla BDOT miał wybrany jakiś operat, GESUT modyfikowany miał być innym opracowaniem, a funkcja automatycznego powielania operacji między bazami operatów zadziałała tak, jak miała zadziałać, bo do tego jest stworzona, i koledze trochę to namieszało (tak to z wypowiedzi zrozumiałem) 

Wyłącz opcję "automatycznego powielanie operacji między bazami operatów" i zmień numer operatu w bazie GESUT.

ewopis:
Słowniki\Jednostki ewidencyjne\zakładka "EWMAPA" pole "ident. w EWMapie"

ewmapa:
konfiguracja baz :
główna baza\ pole "identyfikator bazy dla interfejsów"
inne\identyfikator bazy dla interfejsów\
inne\sterowanie

Walidator EGiB zgłasza błędy przy braku linii kierunkowej w obiektach, dla których taka linia jest wymagana (np. schody)

W ewmapie masz ustawiony ten sam identyfikator, który podałeś w ewopisie?